Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD226-207ENST00000582621 1458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016956.1-201ENST00000393026 1108 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012506.2-201ENST00000426527 533 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB5-205ENST00000472629 744 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000793.1-201ENST00000527364 740 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001021.2-201ENST00000577935 544 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms