RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419224.1

USP9YP20-201, Transcript of USP9Y pseudogene 20, humanhuman

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Gene USP9YP20, Length 558 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP20-201ENST00000419224 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
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USP9YP20-201ENST00000419224 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
USP9YP20-201ENST00000419224 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
USP9YP20-201ENST00000419224 FOXD1Q16676 465 aa22.3■■□□□ 1.16
USP9YP20-201ENST00000419224 POTEDQ86YR6 584 aa21.55■■□□□ 1.04
USP9YP20-201ENST00000419224 MSH5O43196 834 aa21■□□□□ 0.95
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USP9YP20-201ENST00000419224 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.46■□□□□ 0.87
USP9YP20-201ENST00000419224 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.36■□□□□ 0.85
USP9YP20-201ENST00000419224 ADRA2BP18089 450 aa20.32■□□□□ 0.84
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USP9YP20-201ENST00000419224 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
USP9YP20-201ENST00000419224 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.97■□□□□ 0.47
USP9YP20-201ENST00000419224 RNF39Q9H2S5 420 aa17.93■□□□□ 0.46
USP9YP20-201ENST00000419224 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
USP9YP20-201ENST00000419224 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.8■□□□□ 0.44
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USP9YP20-201ENST00000419224 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
USP9YP20-201ENST00000419224 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.57■□□□□ 0.4
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USP9YP20-201ENST00000419224 POTEHQ6S545 545 aa16.74■□□□□ 0.27
USP9YP20-201ENST00000419224 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
USP9YP20-201ENST00000419224 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
USP9YP20-201ENST00000419224 DSG3P32926 999 aa16.6■□□□□ 0.25
USP9YP20-201ENST00000419224 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
USP9YP20-201ENST00000419224 CAPN15O75808 1086 aa16.49■□□□□ 0.23
USP9YP20-201ENST00000419224 SLC4A2P04920 1241 aa16.16■□□□□ 0.18
USP9YP20-201ENST00000419224 ABCB7O75027 752 aa16.09■□□□□ 0.17
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USP9YP20-201ENST00000419224 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP9YP20-201ENST00000419224 APLP2Q06481 763 aa15.95■□□□□ 0.14
USP9YP20-201ENST00000419224 KCNA4P22459 653 aa15.9■□□□□ 0.14
USP9YP20-201ENST00000419224 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
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USP9YP20-201ENST00000419224 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.7■□□□□ 0.1
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USP9YP20-201ENST00000419224 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
USP9YP20-201ENST00000419224 AKT1S1Q96B36 256 aa15.32■□□□□ 0.04
USP9YP20-201ENST00000419224 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.23■□□□□ 0.03
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USP9YP20-201ENST00000419224 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
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USP9YP20-201ENST00000419224 ZBTB22O15209 634 aa14.66□□□□□ -0.06
USP9YP20-201ENST00000419224 SPDYE6P0CI01 402 aa14.66□□□□□ -0.06
USP9YP20-201ENST00000419224 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.66□□□□□ -0.06
USP9YP20-201ENST00000419224 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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USP9YP20-201ENST00000419224 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.52□□□□□ -0.09
USP9YP20-201ENST00000419224 GABBR2O75899 941 aa14.51□□□□□ -0.09
USP9YP20-201ENST00000419224 FBLN2P98095 1184 aa14.51□□□□□ -0.09
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USP9YP20-201ENST00000419224 LHX8Q68G74 356 aa14.45□□□□□ -0.1
USP9YP20-201ENST00000419224 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.45□□□□□ -0.1
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USP9YP20-201ENST00000419224 CHADLQ6NUI6 762 aa14.37□□□□□ -0.11
USP9YP20-201ENST00000419224 POTEIP0CG38 1075 aa14.26□□□□□ -0.13
USP9YP20-201ENST00000419224 PRR29P0C7W0 189 aa14.2□□□□□ -0.14
USP9YP20-201ENST00000419224 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.17□□□□□ -0.14
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USP9YP20-201ENST00000419224 CLCN6P51797 869 aa14□□□□□ -0.17
USP9YP20-201ENST00000419224 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.95□□□□□ -0.18
USP9YP20-201ENST00000419224 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.92□□□□□ -0.18
USP9YP20-201ENST00000419224 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
USP9YP20-201ENST00000419224 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.83□□□□□ -0.2
USP9YP20-201ENST00000419224 OTUD5Q96G74 571 aa13.81□□□□□ -0.2
USP9YP20-201ENST00000419224 CREBZFQ9NS37 354 aa13.8□□□□□ -0.2
USP9YP20-201ENST00000419224 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
USP9YP20-201ENST00000419224 POTEB2H3BUK9 544 aa13.78□□□□□ -0.2
USP9YP20-201ENST00000419224 PHF12Q96QT6 1004 aa13.64□□□□□ -0.23
USP9YP20-201ENST00000419224 POTEMA6NI47 508 aa13.63□□□□□ -0.23
USP9YP20-201ENST00000419224 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
USP9YP20-201ENST00000419224 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.61□□□□□ -0.23
USP9YP20-201ENST00000419224 POTEGQ6S5H5 508 aa13.58□□□□□ -0.24
USP9YP20-201ENST00000419224 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
USP9YP20-201ENST00000419224 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
USP9YP20-201ENST00000419224 POTEJP0CG39 1038 aa13.51□□□□□ -0.25
USP9YP20-201ENST00000419224 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
USP9YP20-201ENST00000419224 METRNQ9UJH8 293 aa13.44□□□□□ -0.26
USP9YP20-201ENST00000419224 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.43□□□□□ -0.26
USP9YP20-201ENST00000419224 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.42□□□□□ -0.26
USP9YP20-201ENST00000419224 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
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