Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms