Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGAP1Q96PV0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms