Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00526Q96FQ7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms