Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMA16Q96EY4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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