Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C18orf8Q96DM3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms