Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYC1

CLVS2, Clavesin-2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS2Q5SYC1 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLVS2Q5SYC1 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLVS2Q5SYC1 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLVS2Q5SYC1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLVS2Q5SYC1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLVS2Q5SYC1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLVS2Q5SYC1 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLVS2Q5SYC1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLVS2Q5SYC1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLVS2Q5SYC1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLVS2Q5SYC1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms