Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms