Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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ZNF239Q16600 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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