Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PDCD2Q16342 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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