Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms