Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NWD1Q149M9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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