Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RAB39AQ14964 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms