Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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