Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CUL3Q13618 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CUL3Q13618 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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