Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRG1Q02297 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRG1Q02297 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NRG1Q02297 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NRG1Q02297 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms