Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms