Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms