Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMF1P82094 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMF1P82094 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMF1P82094 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMF1P82094 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMF1P82094 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMF1P82094 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMF1P82094 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMF1P82094 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMF1P82094 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms