Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHBP55084 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHBP55084 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HADHBP55084 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHBP55084 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms