Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPFP49454 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms