Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP5P45974 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP5P45974 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP5P45974 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms