Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV4P43268 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV4P43268 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV4P43268 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms