Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BMI1P35226 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BMI1P35226 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BMI1P35226 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BMI1P35226 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BMI1P35226 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BMI1P35226 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms