Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP1P29466 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms