Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2AP24928 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2AP24928 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms