Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms