Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCP2P22307 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCP2P22307 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCP2P22307 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCP2P22307 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCP2P22307 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCP2P22307 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCP2P22307 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms