Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBSP08397 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBSP08397 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBSP08397 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBSP08397 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBSP08397 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBSP08397 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms