Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNB1P01574 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms