Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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