Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UTP11Q9Y3A2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms