Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRBP1Q9P2E9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms