Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD1BQ9P298 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms