Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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COG4Q9H9E3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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COG4Q9H9E3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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COG4Q9H9E3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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COG4Q9H9E3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COG4Q9H9E3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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