Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CELF4Q9BZC1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms