Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF25Q9BQ70 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms