Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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