Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
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