Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms