Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms