Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms