Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SEC23BQ15437 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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