Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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