Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
EP300Q09472 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EP300Q09472 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms