Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UBXN1Q04323 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms