Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP2C1P98194 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP2C1P98194 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms