Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
JAG1P78504 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms