Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA8P53708 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms